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1.
Biomédica (Bogotá) ; 43(4)dic. 2023.
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1533958

ABSTRACT

Introducción. El comportamiento de la resistencia antimicrobiana es fundamental en el mejoramiento y ajuste de los programas de optimización de uso de antimicrobianos, la implementación de las guías terapéuticas y las precauciones que limitan la transmisión cruzada de bacterias resistentes entre pacientes. Desde el inicio del 2020, la pandemia del SARS-CoV-2 desafió profundamente al sistema de salud y, según algunos reportes, aumentó las tasas de resistencia antimicrobiana. Objetivo. Describir el comportamiento de la resistencia antimicrobiana en los microrganismos más frecuentes en veinte hospitales colombianos durante el periodo 2018-2021. Materiales y métodos. Se trata de un estudio descriptivo basado en la información microbiológica reportada por veinte instituciones de salud de nivel III y IV, entre enero de 2018 y diciembre de 2021, en doce ciudades de Colombia, las cuales hacen parte del "Grupo para el estudio de la resistencia nosocomial en Colombia", liderado por la Universidad El Bosque. La identificación de género y especie de los microorganismos más frecuentes, junto con su perfil de resistencia frente a antibióticos marcadores, se determinaron mediante el análisis de los datos vía WHONET. Resultados. En general, los 10 microorganismos más frecuentes analizados a lo largo de los 4 años no presentaron cambios estadísticamente significativos en sus perfiles de resistencia durante los cuatro años del periodo evaluado, de 2018 a 2021. En contraste, Pseudomonas aeruginosa aumentó su resistencia frente a piperacilinatazobactam y carbapenémicos, lo cual fue estadísticamente significativo. Conclusiones. Los cambios en la resistencia antimicrobiana en estos años no han sido estadísticamente significativos, excepto para P. aeruginosa, bacteria que mostró un incremento en las tasas de resistencia a piperacilina-tazobactam y carbapenémicos.


Introduction. Antimicrobial resistance surveillance is a fundamental tool for the development, improvement, and adjustment of antimicrobial stewardship programs, therapeutic guidelines, and universal precautions to limit the cross-transmission of resistant bacteria between patients. Since the beginning of 2020, the SARS-CoV-2 pandemic profoundly challenged the health system and, according to some reports, increased the rates of antimicrobial resistance. Objective. To describe the behavior of antimicrobial resistance of the most frequent bacterial pathogens in twenty Colombian hospitals from January 2018 to December 2021. Materials and methods. We conducted a descriptive study based on the microbiological information recorded from January 2018 to December 2021 in twenty levels III and IV health institutions in twelve Colombian cities. We identified the species of the ten most frequent bacteria along with their resistance profile to the antibiotic markers after analyzing the data through WHONET. Results. We found no statistically significant changes in most pathogens' resistance profiles from January 2018 to December 2021. Only Pseudomonas aeruginosa had a statistically significant increase in its resistance profile, particularly to piperacillin/ tazobactam and carbapenems. Conclusions. The changes in antimicrobial resistance in these four years were not statistically significant except for P. aeruginosa to piperacillin/tazobactam and carbapenems.

2.
Salud mil ; 42(1): e401, 05/05/2023.
Article in Spanish | LILACS, UY-BNMED, BNUY | ID: biblio-1531497

ABSTRACT

Introducción: la resistencia a los antimicrobianos ha sido una problemática creciente a nivel global, la problemática afecta no solo la salud de personas, animales y el ambiente en general, sino que ha generado impactos de índole productivo y comercial. Una de las estrategias para abordar esta problemática es el enfoque de una salud. Este enfoque destaca la participación multidisciplinaria para combatir la resistencia antimicrobiana; y es así que cada profesión o actividad laboral genera unas responsabilidades innatas para la profesión veterinaria. Los veterinarios tienen un rol fundamental para este propósito, ya que son ellos quienes integran la aplicabilidad de estrategias de promoción y prevención a nivel agropecuario, y de consolidación e interlocución entre los diferentes componentes del enfoque (animal, humano, ambiente) desde el ámbito de la salud pública veterinaria. Materiales y Método: se realizó una búsqueda de la literatura en diferentes bases de datos, con el objetivo de realizar una revisión actualizada sobre la resistencia antimicrobiana. Resultados: dentro de las principales estrategias se debería fomentar un uso adecuado y bajo prescripción de antimicrobianos en la producción animal. Promover buenas prácticas de higiene, bioseguridad y vacunación, facilitando un correcto diagnóstico de enfermedades infecciosas en animales. Discusión: la adopción de normas internacionales para el uso responsable de los antibióticos y las directrices establecidas por la Organización Mundial de la Salud y Organización de las Naciones Unidas para la Alimentación y la Agricultura, a través del Codex Alimentarius y la Organización Mundial de Sanidad Animal, son fundamentales para hacer frente al desafío que representa el problema de la resistencia a los antimicrobianos.


Introduction: Antimicrobial resistance has been a growing problem at a global level, affecting not only the health of people, animals and the environment in general, but it has also generated impacts of a productive and commercial nature. One of the strategies to address this problem is the one-health approach. This approach emphasizes multidisciplinary participation to combat antimicrobial resistance; and thus, each profession or work activity generates innate responsibilities for the veterinary profession. Veterinarians have a fundamental role for this purpose, since they are the ones who integrate the applicability of promotion and prevention strategies at the agricultural level, and of consolidation and interlocution between the different components of the approach (animal, human, environment) from the field of veterinary public health. Materials and Method: a literature search was carried out in different databases, with the aim of carrying out an updated review on antimicrobial resistance. Results: one of the main strategies should be to promote an adequate use and under prescription of antimicrobials in animal production. Promote good hygiene, biosecurity and vaccination practices, facilitating a correct diagnosis of infectious diseases in animals. Discussion: the adoption of international standards for the responsible use of antibiotics and the guidelines established by the World Health Organization and the Food and Agriculture Organization of the United Nations, through Codex Alimentarius and the World Organization for Animal Health, are fundamental to face the challenge posed by the problem of antimicrobial resistance.


Introdução: A resistência antimicrobiana tem sido um problema crescente em todo o mundo, afetando não apenas a saúde dos seres humanos, dos animais e do meio ambiente em geral, mas também causando impactos na produção e no comércio. Uma das estratégias para lidar com esse problema é a abordagem One Health. Essa abordagem enfatiza o envolvimento multidisciplinar no combate à resistência antimicrobiana, com cada profissão ou atividade de trabalho gerando responsabilidades inatas à profissão veterinária. Os veterinários têm um papel fundamental nesse sentido, pois são eles que integram a aplicabilidade das estratégias de promoção e prevenção em nível agropecuário e de consolidação e interlocução entre os diferentes componentes da abordagem (animal, humano, ambiental) do campo da saúde pública veterinária. Materiais e Métodos: foi realizada uma pesquisa bibliográfica em diferentes bases de dados, com o objetivo de realizar uma revisão atualizada sobre a resistência antimicrobiana. Resultados: uma das principais estratégias deve ser a promoção do uso adequado e com baixa prescrição de antimicrobianos na produção animal. Promover boas práticas de higiene, biossegurança e vacinação, facilitando o diagnóstico correto de doenças infecciosas em animais. Discussão: A adoção de padrões internacionais para o uso responsável de antibióticos e as diretrizes estabelecidas pela Organização Mundial da Saúde e pela Organização das Nações Unidas para Agricultura e Alimentação, por meio do Codex Alimentarius e da Organização Mundial de Saúde Animal, são essenciais para enfrentar o desafio representado pelo problema da resistência antimicrobiana.


Subject(s)
Humans , Animals , Drug Resistance, Microbial/drug effects , Drug Resistance, Multiple/drug effects
3.
ABCS health sci ; 48: e023218, 14 fev. 2023. tab
Article in English | LILACS | ID: biblio-1516691

ABSTRACT

INTRODUCTION: Antimicrobial resistance developed through the inadequate use of antibiotics; is an overriding task for global public health. OBJECTIVE: To explore awareness, knowledge, and practices, and compare the elements associated with antibiotic misuse in different University students and uneducated people of Khyber Pakhtunkhwa Province, Pakistan. METHODS: Cross-sectional study was conducted from July to December 2020 using a validated questionnaire. Data were collected from eleven different university students and uneducated people of Khyber Pakhtunkhwa, Pakistan. RESULTS: 3,600 questionnaires were completed, consisting of 56.9% Male and 43.0% Female. 1,999 (55.5%) of the antibiotic users reported through the survey used non-prescription antibiotics within a one-month study period. Out of the participants, 230 (6.3%) were uneducated or their education level was below matric rest were university students. 1999 (55.5%) reported buying Antibiotics with Medical Prescription. Most self-medicated participants (56.9%) stop taking antibiotics when they feel better. More than 90% of the respondents answered that doctors and pharmacist staff do not guide them well that how to use antibiotics. 2,171 (60.03%) respondents mistakenly believed that antibiotics improve restoration from coughs and colds. Only 720 (20%) respondents knew that antibiotics also disturb normal flora and 547 participants (15.9%) agree that unnecessary use of antibiotics causes bacterial resistance. CONCLUSION: Finding from this study may have important implications for public health policy in Khyber Pakhtunkhwa, Pakistan given the growing global resistance to antibiotics and the reported health issues related to their improper use.


Subject(s)
Humans , Male , Female , Adolescent , Adult , Young Adult , Self Medication , Students , Universities , Health Knowledge, Attitudes, Practice , Anti-Bacterial Agents , Pakistan , Cross-Sectional Studies
4.
São José dos Campos; s.n; 2023. 85 p. tab, ilus.
Thesis in Portuguese | LILACS, BBO | ID: biblio-1416795

ABSTRACT

Extratos de plantas têm demonstrado diversos efeitos positivos para a saúde, incluindo ação antimicrobiana, no entanto, o uso clínico da fitoterapia ainda é discreto, de modo que mais estudos sobre os efeitos benéficos do sinergismo farmacológico de extratos poderiam contribuir para sua aplicação terapêutica. O objetivo deste estudo foi avaliar os efeitos dos extratos glicólicos de gengibre (EG) e quilaia (EQ) isolados e em associação sobre 7 cepas clínicas de Pseudomonas aeruginosa e uma cepa padrão em forma planctônica e biofilmes monotípicos. Para a análise antimicrobiana sobre cultura planctônica foram feitos testes para determinação de Concentração Inibitória Mínima (CIM) e Concentração Microbicida Mínima (CMM) (CLSI, M07-A9) dos extratos isolados, além do Índice de Concentração Inibitória Fracionada (ICIF) e do Índice de Concentração Microbicida Fracionada (ICMF) para os extratos combinados. A análise estatística foi feita com método ANOVA e teste de Tukey para dados com distribuição normal e Kruskall-Wallis com Teste de Comparação Múltipla de Dunn para dados sem distribuição normal (significância de 5%). Para cepa padrão foram determinadas CIM igual a 3,12 mg/mL e CMM igual a 6,25 mg/mL para ambos os extratos. Para cepas clínicas as CIM do EG foram 3,12 ou 6,25 mg/mL e de EQ 1,56 ou 3,12 mg/mL, enquanto os valores de CMM foram de 6,25 mg/mL para EG e de 1,56, 3,12 ou 6,25 mg/mL para EQ. Os resultados de ICIF indicaram 15 associações sinérgicas e 4 associações aditivas dos extratos contra a cepa padrão e, dentre cepas clínicas, foram obtidos 15 resultados aditivos. A partir dos resultados de ICMF foram identificadas 6 associações sinérgicas e 1 associação aditiva contra a cepa padrão, além de 8 associações com efeito aditivo contra cepas clínicas. A partir dos resultados de testes em culturas planctônicas foi avaliada a ação antibiofilme sobre as cepas em que foram observadas reduções de viabilidade de 36,7 e 34% para o EG (50 e 25 mg/mL) e 51,3 e 51,4% para EQ (25 e 12,5 mg/mL) contra cepa padrão. As reduções em cepas clínicas variaram de 43 a 73% com EG e de 36 a 79% para EQ. As associações dos extratos promoveram reduções de viabilidade de 8 a 35% contra 5 das 7 cepas clínicas. Conclui-se que os extratos glicólicos de gengibre e quilaia apresentam ação antimicrobiana de forma isolada e combinados com efeito aditivo sobre a forma planctônica de cepas clínicas resistentes de P. aeruginosa. De forma isolada, os extratos apresentaram importante ação preventiva na formação dos biofilmes dessas cepas, podendo ser considerados potenciais fitoterápicos com aplicações terapêuticas para o combate das infecções por P. aeruginosa. (AU)


Plant extracts have demonstrated several positive health effects, including antimicrobial action, however, the clinical use of phytotherapy is still discreet, so that more studies on the beneficial effects of pharmacological synergism of extracts could contribute to its therapeutic application. The aim of this study was to evaluate the effects of glycolic extracts of ginger (EG) and quilaia (EQ) alone and in combination on 7 clinical strains of Pseudomonas aeruginosa and a standard strain in planktonic form and monotypic biofilms. For the antimicrobial analysis on planktonic culture, tests were performed to determine the Minimum Inhibitory Concentration (MIC) and Minimum Microbicidal Concentration (MMC) (CLSI, M07-A9) of the isolated extracts, in addition to the Fractional Inhibitory Concentration Index (FICI) and the Fractionated Microbicidal Concentration Index (FICM) for the combined extracts. Statistical analysis was performed using the ANOVA method and Tukey's test for data with normal distribution and Kruskall-Wallis with Dunn's Multiple Comparison Test for data without normal distribution (5% significance). For the standard strain, MIC were determined equal to 3.12 mg/mL and MMC equal to 6.25 mg/mL for both extracts. For clinical strains the MIC of EG were 3.12 or 6.25 mg/mL and 1.56 or 3.12 mg/mL of EQ, while the MMC values were 6.25 mg/mL for EG and 1.56, 3.12 or 6.25 mg/ml for EQ. The FICI results indicated 15 synergistic and 4 additive associations of the extracts against the standard strain and, among clinical strains, 15 additive results were obtained. From the FICM results, 6 synergistic and 1 additive association against the standard strain were identified, in addition to 8 associations with additive effect against clinical strains. Based on the results of tests on planktonic cultures, the antibiofilm action were evaluated on the strains in which viability reductions of 36 and 34% were observed for EG (50 and 25 mg/mL) and 51% were observed for EQ (25 and 12, 5 mg/mL) against the standard strain. Reductions in clinical strains ranged from 43 to 73% with EG and from 36 to 79% for EQ. Associations of extracts promoted viability reductions of 8 to 35% against 5 out of 7 clinical strains. It is concluded that the glycolic extracts of ginger and quilaia have antimicrobial action in isolation and combined with additive effect on the planktonic form of resistant clinical strains of P. aeruginosa. Isolated, the extracts showed an important preventive action in the formation of biofilms of these strains and may be considered potential herbal medicines with therapeutic applications to combat P. aeruginosa infections. (AU)


Subject(s)
Pseudomonas aeruginosa , Drug Resistance, Microbial , Biofilms , Phytotherapy , Anti-Bacterial Agents
5.
Rev. panam. salud pública ; 47: e106, 2023. tab, graf
Article in English | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1450288

ABSTRACT

ABSTRACT Objective. To explore the antimicrobial stewardship policy landscape in three English-speaking Caribbean countries (Barbados, Guyana, and Saint Lucia) and examine the key enablers and challenges to the design and implementation of formal antimicrobial stewardship programs. Methods. A document analysis that searched for existing policy, communications, and contributions on antimicrobial stewardship from these three countries, adapting the READ (Ready materials; Extract data; Analyze data; Distill findings) approach, a systematic procedure for health policy document review. Results. The search strategy identified 726 initial records. Of those, 15 (2%) met the inclusion criteria. The analysis included official policy documents (n = 3), scholarly works/reviews (n = 3), advocacy documents (n = 2), news articles (n = 4), and confidential reports (n = 3) from the three countries. Conclusions. Critical matters such as cross-programmatic coordination, the significance of individual action, and the need for bidirectional knowledge discourse are prominent in optimizing antimicrobial stewardship adaptation in these countries. CARICOM regional coordination has positively impacted the integration of infection prevention and control with antimicrobial stewardship across this knowledge network.


RESUMEN Objetivo. Explorar el panorama de las políticas de optimización del uso de antimicrobianos en tres países caribeños de habla inglesa (Barbados, Guyana y Santa Lucía) y examinar los principales facilitadores y desafíos para elaborar y aplicar programas formales de optimización del uso de antimicrobianos. Métodos. Se adaptó el método READ (acrónimo en inglés de "materiales listos; extraer los datos; analizar los datos; destilar los resultados"), un procedimiento sistemático para la revisión de documentos sobre políticas de salud, a fin de realizar un análisis de documentos que buscó las políticas, comunicaciones y contribuciones existentes sobre la optimización del uso de antimicrobianos en esos tres países. Resultados. La estrategia de búsqueda permitió localizar 726 documentos iniciales. De ellos, 15 (el 2%) cumplían los criterios de inclusión. El análisis abarcó documentos oficiales de políticas (n = 3), trabajos académicos o revisiones (n = 3), documentos de promoción de la causa (n = 2), artículos de noticias (n = 4) e informes confidenciales (n = 3) de los tres países. Conclusiones. Varios aspectos críticos, como la coordinación interprogramática, la importancia de la acción individual y la necesidad de una comunicación bidireccional del conocimiento, son preponderantes para adaptar de la mejor manera la optimización del uso de antimicrobianos en estos países. La coordinación regional de la CARICOM ha influido positivamente para integrar la prevención y el control de infecciones con la optimización del uso de antimicrobianos en toda esta red de conocimientos.


RESUMO Objetivo. Explorar o cenário da política para uso racional de antibióticos em três países anglófonos do Caribe (Barbados, Guiana e Santa Lúcia) e examinar os principais fatores facilitadores e desafios para a elaboração e implementação de programas formais de uso racional de antibióticos. Métodos. Análise de documentos em busca de políticas, comunicações e contribuições existentes sobre o uso racional de antibióticos nesses três países, adaptando a abordagem READ (sigla em inglês para preparar materiais, extrair e analisar dados e destacar os principais achados), um procedimento sistemático para a revisão de documentos de políticas de saúde. Resultados. A estratégia de busca identificou 726 registros iniciais. Desses, 15 (2%) atenderam aos critérios de inclusão. A análise incluiu documentos oficiais de políticas (n = 3), trabalhos acadêmicos/revisões (n = 3), documentos em defesa da causa (n = 2), reportagens (n = 4) e relatórios confidenciais (n = 3) dos três países. Conclusões. Questões críticas, como a coordenação interprogramática, a importância da ação individual e a necessidade de um discurso bidirecional de conhecimento, se destacam na adaptação otimizada das diretrizes de uso racional de antibióticos nesses países. A coordenação regional da Comunidade do Caribe (CARICOM) contribuiu para integrar a prevenção e o controle de infecções ao uso racional de antibióticos em toda essa rede de conhecimento.

6.
Rev. panam. salud pública ; 47: e57, 2023. tab
Article in English | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1432084

ABSTRACT

ABSTRACT Objective. To determine the prevalence and antimicrobial resistance of Escherichia coli and Salmonella spp. in animal feed samples collected between 2018 and 2021 in Colombia. Methods. This was a laboratory-based cross-sectional study using routine data from the program for inspection, surveillance, and control of animal feed at the Colombian Agriculture Institute. Samples of animal feed for swine, poultry, canine, feline, leporine, piscine, and equine species were processed for detection of E. coli and Salmonella spp. using enrichment and selective culture methods. Isolates were tested for antimicrobial susceptibility using an automated microdilution method. Results. Of 1 748 animal feed samples analyzed, 83 (4.7%) were positive for E. coli and 66 (3.8%) for Salmonella spp. The presence of E. coli and Salmonella spp. was highest in feed for poultry (6.4% and 5.5%) and swine (6.1% and 4.3%). Antimicrobial resistance testing was performed in 27 (33%) E. coli isolates and 26 (39%) Salmonella isolates. Among E. coli, resistance was most frequently observed to ampicillin (44.5%) followed by cefazolin (33.3%), ciprofloxacin (29.6%), ampicillin/sulbactam (26%), and ceftriaxone (11.1%). The highest resistance levels in Salmonella spp. isolates were against cefazolin (7.7%) and piperacillin/tazobactam (7.7%). Conclusions. This is the first study from Colombia reporting on the prevalence and antimicrobial resistance of E. coli and Salmonella spp. in animal feed samples. Its results establish a baseline over a wide geographical distribution in Colombia. It highlights the need to integrate antimicrobial resistance surveillance in animal feed due to the emergence of resistant bacteria in this important stage of the supply chain.


RESUMEN Objetivo. Determinar la prevalencia y resistencia a los antimicrobianos de Escherichia coli y Salmonella spp. en muestras de piensos para animales tomadas entre el 2018 y el 2021 en Colombia. Métodos. Se trata de un estudio transversal realizado en el laboratorio a partir de los datos regulares del programa de inspección, vigilancia y control de alimentos para animales del Instituto Colombiano Agropecuario. Se procesaron muestras de alimentos utilizados en la cría de cerdos, aves de corral, cánidos, félidos, lepóridos, peces y equinos con el fin de detectar E. coli y Salmonella spp. por medio de métodos de enriquecimiento y cultivo selectivo. Se analizó la sensibilidad a los antimicrobianos de las cepas aisladas mediante microdilución automatizada. Resultados. De 1748 muestras de alimentos analizadas, 83 (4,7%) resultaron positivas para E. coli y 66 (3,8%) para Salmonella spp. La presencia de E. coli y Salmonella spp. fue mayor en los alimentos para aves de corral (6,4% y 5,5%) y cerdos (6,1% y 4,3%). Se realizaron pruebas de resistencia a los antimicrobianos en 27 (33%) cepas de E. coli y 26 (39%) de Salmonella. En las cepas de E. coli, se observó una mayor resistencia a la ampicilina (44,5%), seguida de la resistencia a la cefazolina (33,3%), la ciprofloxacina (29,6%), la ampicilina/sulbactam (26%) y la ceftriaxona (11,1%). En el caso de las cepas de Salmonella spp., los niveles de resistencia más elevados fueron para la cefazolina (7,7%) y piperacilina/tazobactam (7,7%). Conclusiones. Este es el primer estudio realizado en Colombia en el que se informa sobre la prevalencia y la resistencia a los antimicrobianos de E. coli y Salmonella spp. en muestras de alimentos para animales. Sus resultados establecen una línea de base para una zona geográfica mucho mayor dentro de Colombia. Se subraya la necesidad de integrar la vigilancia de la resistencia a los antimicrobianos en los alimentos para animales debido a la aparición de bacterias resistentes en esta importante etapa de la cadena de suministro.


RESUMO Objetivo. Determinar a prevalência e a resistência a antimicrobianos de Escherichia coli e Salmonela spp. em amostras de ração animal coletadas entre 2018 e 2021 na Colômbia. Métodos. Estudo transversal de base laboratorial, usando dados de rotina do programa de inspeção, vigilância e controle de ração animal do Instituto Colombiano de Agricultura. Amostras de ração animal para as espécies suína, avícola, canina, felina, leporina, piscina e equina foram processadas para detecção de E. coli e Salmonella spp., usando métodos de enriquecimento e cultura seletiva. Os isolados foram testados quanto à suscetibilidade a antimicrobianos usando um método automatizado de microdiluição. Resultados. Das 1.748 amostras de ração animal analisadas, 83 (4,7%) foram positivas para E. coli e 66 (3,8%) para Salmonella spp. A presença de E. coli e Salmonella spp. foi maior em rações para aves (6,4% e 5,5%) e suínos (6,1% e 4,3%). O teste de resistência a antimicrobianos foi realizado em 27 (33%) isolados de E. coli e 26 (39%) isolados de Salmonella. Em E. coli, a resistência observada com maior frequência foi à ampicilina (44,5%), seguida da cefazolina (33,3%), ciprofloxacino (29,6%), ampicilina/sulbactam (26%) e ceftriaxona (11,1%). Os maiores níveis de resistência em isolados de Salmonella spp. foram contra cefazolina (7,7%) e piperacilina/tazobactam (7,7%). Conclusões. Este é o primeiro estudo da Colômbia a notificar a prevalência e resistência a antimicrobianos de E. coli e Salmonella spp. em amostras de ração animal. Os resultados estabelecem uma linha de base com ampla distribuição geográfica na Colômbia. Destaca-se a necessidade de integrar a vigilância da resistência a antimicrobianos na ração animal, devido ao surgimento de bactérias resistentes nesta importante etapa da cadeia de abastecimento.

7.
Rev. panam. salud pública ; 47: e10, 2023. tab
Article in English | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1432090

ABSTRACT

ABSTRACT Objective. To assess changes in antibiotic resistance of eight of the World Health Organization priority bug-drug combinations and consumption of six antibiotics (ceftriaxone, cefepime, piperacillin/tazobactam, meropenem, ciprofloxacin, vancomycin) before (March 2018 to July 2019) and during (March 2020 to July 2021) the COVID-19 pandemic in 31 hospitals in Valle del Cauca, Colombia. Methods. This was a before/after study using routinely collected data. For antibiotic consumption, daily defined doses (DDD) per 100 bed-days were compared. Results. There were 23 405 priority bacterial isolates with data on antibiotic resistance. The total number of isolates increased from 9 774 to 13 631 in the periods before and during the pandemic, respectively. While resistance significantly decreased for four selected bug-drug combinations (Klebsiella pneumoniae, extended spectrum beta lactamase [ESBL]-producing, 32% to 24%; K. pneumoniae, carbapenem-resistant, 4% to 2%; Pseudomonas aeruginosa, carbapenem-resistant, 12% to 8%; Acinetobacter baumannii, carbapenem-resistant, 23% to 9%), the level of resistance for Enterococcus faecium to vancomycin significantly increased (42% to 57%). There was no change in resistance for the remaining three combinations (Staphylococcus aureus, methicillin-resistant; Escherichia coli, ESBL-producing; E. coli, carbapenem-resistant). Consumption of all antibiotics increased. However, meropenem consumption decreased in intensive care unit settings (8.2 to 7.1 DDD per 100 bed-days). Conclusions. While the consumption of antibiotics increased, a decrease in antibiotic resistance of four bug-drug combinations was observed during the pandemic. This was possibly due to an increase in community-acquired infections. Increasing resistance of E. faecium to vancomycin must be monitored. The findings of this study are essential to inform stewardship programs in hospital settings of Colombia and similar contexts elsewhere.


RESUMEN Objetivo. Evaluar los cambios en la resistencia a los antibióticos de ocho de las combinaciones de fármacos y agentes patógenos incluidos en la lista prioritaria de la Organización Mundial de la Salud y el consumo de seis antibióticos (ceftriaxona, cefepima, piperacilina/tazobactam, meropenem, ciprofloxacina, vancomicina) antes de la pandemia de COVID-19 (de marzo del 2018 a julio del 2019) y durante la pandemia (de marzo del 2020 a julio del 2021) en 31 hospitales del Valle del Cauca (Colombia). Métodos. En este estudio se analiza el antes y el después empleando datos recopilados de forma rutinaria. Para el consumo de antibióticos, se compararon las dosis diarias definidas (DDD) por 100 días-cama. Resultados. Hubo 23 405 cepas bacterianas aisladas prioritarias con datos sobre la resistencia a los antibióticos. El número total de cepas aisladas aumentó de 9 774 antes de la pandemia a 13 631 durante la pandemia. Si bien la resistencia disminuyó significativamente en las cuatro combinaciones seleccionadas de agentes patógenos y fármacos (Klebsiella pneumoniae, productora de betalactamasa de espectro extendido [BLEE], de 32% a 24%; K. pneumoniae, resistente a los carbapenémicos, de 4% a 2%; Pseudomonas aeruginosa, resistente a los carbapenémicos, de 12% a 8%; Acinetobacter baumannii, resistente a los carbapenémicos, de 23% a 9%), el nivel de resistencia de Enterococcus faecium a la vancomicina aumentó significativamente (de 42% a 57%). No hubo cambios en la resistencia en las tres combinaciones restantes (Staphylococcus aureus, resistente a la meticilina; Escherichia coli, productora de BLEE; E. coli, resistente a los carbapenémicos). El consumo de todos los antibióticos aumentó. Sin embargo, el consumo de meropenem disminuyó en los entornos de las unidades de cuidados intensivos (de 8,2 a 7,1 DDD por 100 días-cama). Conclusiones. Aunque el consumo de antibióticos aumentó, se observó una disminución en la resistencia a los antibióticos de cuatro combinaciones de agentes patógenos y medicamentos durante la pandemia, que posiblemente se debió a un aumento en las infecciones adquiridas en la comunidad. Es necesario vigilar el aumento de la resistencia de E. faecium a la vancomicina. Los resultados de este estudio son esenciales para que sirvan de orientación en los programas de optimización del uso de los antibióticos en los entornos hospitalarios de Colombia y en contextos similares en otros lugares.


RESUMO Objetivo. Avaliar as mudanças na resistência a antibióticos em oito das combinações microrganismo/antimicrobiano prioritárias da Organização Mundial da Saúde e o consumo de seis antibióticos (ceftriaxona, cefepima, piperacilina/tazobactam, meropeném, ciprofloxacino, vancomicina) antes (março de 2018 a julho de 2019) e durante (março de 2020 a julho de 2021) a pandemia de COVID-19 em 31 hospitais em Valle del Cauca, Colômbia. Métodos. Este foi um estudo antes/depois utilizando dados coletados rotineiramente. Para avaliar o consumo de antibióticos, foram comparadas doses diárias definidas (DDD) por 100 leitos-dias. Resultados. Havia dados sobre resistência a antibióticos para 23.405 isolados bacterianos prioritários. O número total de isolados aumentou de 9.774 para 13.631 antes e durante a pandemia, respectivamente. Embora a resistência tenha diminuído significativamente para quatro das combinações microrganismo/antimicrobiano selecionadas (Klebsiella pneumoniae, produtora de betalactamase de espectro estendido [ESBL], 32% a 24%; K. pneumoniae, resistente a carbapenêmicos, 4% a 2%; Pseudomonas aeruginosa, resistente a carbapenêmicos, 12% a 8%; Acinetobacter baumannii, resistente a carbapenêmicos, 23% a 9%), o nível de resistência de Enterococcus faecium a vancomicina aumentou significativamente (42% a 57%). Não houve mudança na resistência para as três combinações restantes (Staphylococcus aureus, resistente a meticilina; Escherichia coli, produtora de ESBL; E. coli, resistente a carbapenêmicos). O consumo de todos os antibióticos aumentou. Entretanto, o consumo de meropeném nas unidades de terapia intensiva diminuiu (de 8,2 para 7,1 DDD por 100 leitos-dias). Conclusões. Embora o consumo de antibióticos tenha aumentado, observou-se uma diminuição na resistência a antibióticos de quatro combinações microrganismo/antimicrobiano durante a pandemia. Isso ocorreu possivelmente devido a um aumento nas infecções adquiridas na comunidade. O aumento da resistência de E. faecium à vancomicina deve ser monitorado. Os achados deste estudo são essenciais para guiar os programas de gerenciamento de antimicrobianos em ambientes hospitalares da Colômbia e em outros contextos similares.

8.
Rev. panam. salud pública ; 47: e8, 2023. tab, graf
Article in English | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1432098

ABSTRACT

ABSTRACT Whole-genome sequencing is becoming the gold standard for pathogen characterization and offers considerable advantages for understanding the evolution and dissemination of new determinants of antimicrobial resistance. Despite the benefits of whole-genome sequencing for pathogen characterization, implementation costs and lack of expertise may limit its use by public health laboratories. This article reviews the advantages of whole-genome sequencing for pathogen characterization and the current status of the use of whole-genome sequencing for antimicrobial resistance surveillance in Ecuador. A roadmap is suggested for including whole-genome sequencing for pathogen characterization based on the needs of the health reference institutions through alliances with Ecuadorian universities. Establishing a partnership between public health institutions and academia would be valuable for clinicians, policy-makers, and epidemiologists who could then take reasonable measures in those areas and establish a basis for adapting One Health strategies to tackle antimicrobial resistance in Ecuador.


RESUMEN La secuenciación del genoma completo, que está pasando a ser el estándar de referencia para la caracterización de agentes patógenos, ofrece ventajas considerables para comprender la evolución y la diseminación de los nuevos determinantes de la resistencia a los antimicrobianos. Sin embargo, a pesar de los beneficios que genera, los costos de ejecución y la falta de experiencia pueden limitar su uso por parte de los laboratorios de salud pública. En este artículo se evalúan las ventajas de la secuenciación del genoma completo para la caracterización de agentes patógenos y el estado actual del uso de la secuenciación del genoma completo en la vigilancia de la resistencia a los antimicrobianos en Ecuador. Se propone una hoja de ruta para incluir la secuenciación del genoma completo para la caracterización de agentes patógenos según las necesidades de las instituciones de salud de referencia, lo que se haría por medio de alianzas con universidades ecuatorianas. Establecer una asociación entre las instituciones de salud pública y los círculos académicos sería sumamente valioso para los médicos, los responsables de las políticas y los epidemiólogos, que podrían adoptar medidas razonables en sus ámbitos y sentar una base para adaptar las estrategias de "Una salud" a fin de abordar la resistencia a los antimicrobianos en Ecuador.


RESUMO O sequenciamento do genoma completo está se tornando o padrão ouro para a caracterização de patógenos e oferece vantagens consideráveis para a compreensão da evolução e disseminação de novos determinantes de resistência aos antimicrobianos. Apesar dos benefícios do sequenciamento do genoma completo para a caracterização de patógenos, os custos de implementação e a falta de especialização podem limitar seu uso pelos laboratórios de saúde pública. Este artigo analisa as vantagens do sequenciamento do genoma completo para a caracterização de patógenos e a situação atual do uso desta técnica para a vigilância da resistência aos antimicrobianos no Equador. Sugere-se um roteiro para incluir o sequenciamento de genomas completos para caracterização de patógenos com base nas necessidades das instituições de saúde de referência, por meio de alianças com universidades equatorianas. A criação de uma parceria entre instituições de saúde pública e entidades acadêmicas seria valiosa para clínicos, formuladores de políticas e epidemiologistas, que poderiam, assim, tomar medidas razoáveis nessas áreas e estabelecer uma base para adaptar estratégias de Saúde Única para combater a resistência aos antimicrobianos no Equador.

9.
Rev. panam. salud pública ; 47: e18, 2023. tab, graf
Article in English | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1432099

ABSTRACT

ABSTRACT Objectives. To assess antibiotic susceptibility of World Health Organization (WHO) priority bacteria (Acinetobacter baumannii, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Salmonella spp., Staphylococcus aureus, and Streptococcus pneumoniae) in blood cultures at the Orinoquía regional hospital in Colombia. Methods. This was cross-sectional study using routine laboratory data for the period 2019-2021. Data on blood samples from patients suspected of a bloodstream infection were examined. We determined: the total number of blood cultures done and the proportion with culture yield; the characteristics of patients with priority bacteria; and the type of bacteria isolated and antibiotic resistance patterns. Results. Of 25 469 blood cultures done, 1628 (6%) yielded bacteria; 774 (48%) of these bacteria were WHO priority pathogens. Most of the priority bacteria isolated (558; 72%) were gram-negative and 216 (28%) were gram-positive organisms. Most patients with priority bacteria (666; 86%) were hospitalized in wards other than the intensive care unit, 427 (55%) were male, and 321 (42%) were ≥ 60 years of age. Of the 216 gram-positive bacteria isolated, 205 (95%) were Staphylococcus aureus. Of the 558 gram-negative priority bacteria isolated, the three most common were Escherichia coli (34%), Klebsiella pneumoniae (28%), and Acinetobacter baumannii (20%). The highest resistance of Staphylococcus aureus was to oxacillin (41%). For gram-negative bacteria, resistance to antibiotics ranged from 4% (amikacin) to 72% (ampicillin). Conclusions. Bacterial yield from blood cultures was low and could be improved. WHO priority bacteria were found in all hospital wards. This calls for rigorous infection prevention and control standards and continued surveillance of antibiotic resistance.


RESUMEN Objetivos. Evaluar la sensibilidad a los antibióticos de las bacterias incluidas en la lista prioritaria de la Organización Mundial de la Salud (OMS) (Acinetobacter baumannii, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Salmonella spp., Staphylococcus aureus y Streptococcus pneumoniae) en hemocultivos en el Hospital Regional de la Orinoquía en Colombia. Métodos. Se trata de un estudio transversal que empleó datos rutinarios de laboratorio del período comprendido entre los años 2019 y 2021. Se examinaron datos de muestras de sangre de pacientes con presunción clínica de infección del torrente sanguíneo. Se determinó el número total de hemocultivos realizados y la proporción cultivos con resultados, las características de los pacientes con bacterias prioritarias, así como el tipo de bacterias aisladas y los patrones de resistencia a los antibióticos. Resultados. De 25 469 hemocultivos realizados, se aislaron bacterias en 1628 (6%); 774 (48%) con agentes patógenos prioritarios de la OMS. La mayoría de las cepas bacterianas prioritarias aisladas (558; 72%) eran gramnegativas y 216 (28%), organismos grampositivos. La mayoría de los pacientes con bacterias prioritarias (666; 86%) fueron hospitalizados en salas distintas de la unidad de cuidados intensivos, 427 (55%) eran varones y 321 (42%) tenían 60 años o más. De las 216 bacterias grampositivas aisladas, 205 (95%) eran Staphylococcus aureus. De las 558 bacterias prioritarias gramnegativas aisladas, las tres más comunes fueron Escherichia coli (34%), Klebsiella pneumoniae (28%) y Acinetobacter baumannii (20%). La mayor resistencia de Staphylococcus aureus fue a la oxacilina (41%). Entre las bacterias gramnegativas, la resistencia a los antibióticos varió del 4% (amikacina) al 72% (ampicilina). Conclusiones. El aislamiento de bacterias en los hemocultivos fue bajo y podría mejorarse. Se encontraron bacterias de la lista prioritaria de la OMS en todas las salas del hospital, por lo que es necesario aplicar rigurosas normas de prevención y control de infecciones y realizar una vigilancia continua de la resistencia a los antibióticos.


RESUMO Objetivos. Avaliar a suscetibilidade a antibióticos das bactérias consideradas prioritárias pela Organização Mundial da Saúde (OMS) (Acinetobacter baumannii, Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Salmonella spp., Staphylococcus aureus e Streptococcus pneumoniae) em hemoculturas coletadas no hospital regional de Orinoquía na Colômbia. Métodos. Estudo transversal utilizando dados laboratoriais de rotina do período 2019-2021. Foram examinados os dados de amostras de sangue de pacientes com suspeita de infecção de corrente sanguínea. Determinamos o número total de hemoculturas realizadas e a proporção de culturas com rendimento, as características dos pacientes com bactérias prioritárias, e o tipo de bactéria isolada e padrões de resistência a antibióticos. Resultados. Das 25.469 hemoculturas realizadas, 1.628 (6%) foram positivas para bactérias, sendo que 774 (48%) dessas bactérias eram da lista de agentes patogênicos prioritários da OMS. A maioria das bactérias prioritárias isoladas (558; 72%) eram gram-negativas e 216 (28%) eram gram-positivas. A maioria dos pacientes com bactérias prioritárias (666; 86%) estava internada em enfermaria, e não em unidade de terapia intensiva. 427 (55%) eram homens e 321 (42%) tinham ≥ 60 anos de idade. Das 216 bactérias gram-positivas isoladas, 205 (95%) eram Staphylococcus aureus. Das 558 bactérias gram-negativas prioritárias isoladas, as três mais frequentes foram Escherichia coli (34%), Klebsiella pneumoniae (28%) e Acinetobacter baumannii (20%). O Staphylococcus aureus apresentou maior resistência à oxacilina (41%). Entre as bactérias gram-negativas, a resistência aos antibióticos variou entre 4% (amicacina) e 72% (ampicilina). Conclusões. O rendimento bacteriano das hemoculturas foi baixo e pode ser melhorado. As bactérias consideradas prioritárias pela OMS foram encontradas em todas as enfermarias do hospital. Os achados exigem normas rigorosas de prevenção e controle de infecção, e vigilância contínua da resistência bacteriana a antibióticos.

10.
Rev. panam. salud pública ; 47: e15, 2023. tab, graf
Article in English | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1432102

ABSTRACT

ABSTRACT Objective. To describe antimicrobial resistance profiles of Escherichia coli and Salmonella spp. isolated from chicken carcasses and the antimicrobials commonly used in animals in Ecuador and provide information on antimicrobial resistance patterns for implementing evidence-based corrective measures. Methods. Meat samples were collected from chicken carcasses in 199 slaughterhouses across Ecuador as part of a national pilot study for monitoring antimicrobial resistance in agricultural sources in 2019. Samples were tested for E. coli and Salmonella spp. Sensitivity to 10 critically important and three highly important antimicrobials (from a human health perspective) was assessed. The country report submitted to the World Organization for Animal Health was accessed to extract the quantity of antimicrobials produced or imported for use in animals. Results. Of 383 samples, E. coli was isolated from 148 (39%) and Salmonella spp. from 20 (5%) samples. Ninety percent of the isolates were resistant to at least one critically important antimicrobial. Resistance was highest to erythromycin (E. coli 76%; Salmonella spp. 85%) and tetracycline (E. coli 71%; Salmonella spp. 90%). Critically or highly important antimicrobials (colistin, tetracycline, trimethoprim/sulfamethoxazole) formed the bulk (87%) of antimicrobials used in animals as per the World Organization for Animal Health report. Conclusions. High prevalence of antimicrobial resistance in poultry in Ecuador calls for the development of guidelines and regulations on the use of antimicrobials and for engagement with livestock producers. The existing surveillance system needs to be strengthened to improve the monitoring of antimicrobial use and evolving resistance patterns.


RESUMEN Objetivo. Describir los perfiles de resistencia antimicrobiana de las bacterias Escherichia coli y Salmonella spp. aisladas en carne de pollo y los antimicrobianos comúnmente empleados en animales en Ecuador, así como proporcionar información sobre los patrones de resistencia a los antimicrobianos para poner en marcha medidas correctivas basadas en la evidencia. Métodos. Se recogieron muestras de carne de pollo en 199 mataderos de todo Ecuador en el marco de un estudio piloto nacional para monitorear la resistencia a los antimicrobianos en fuentes agrícolas en el 2019. Se analizaron las muestras en busca de E. coli y Salmonella spp. Se evaluó la sensibilidad a diez antimicrobianos de importancia crítica y tres muy importantes (para la salud humana). Se accedió al informe de país presentado ante la Organización Mundial de Sanidad Animal para obtener la cantidad de antimicrobianos producidos o importados para su uso en animales. Resultados. De 383 muestras, se aisló E. coli en 148 (39%) y Salmonella spp. en 20 (5%). En total, 90% de las cepas aisladas fueron resistentes a al menos un antimicrobiano de importancia crítica. Hubo una mayor resistencia a la eritromicina (E. coli: 76%; Salmonella spp.: 85%) y a la tetraciclina (E. coli: 71%; Salmonella spp.: 90%). Los antimicrobianos de importancia crítica o muy importantes (colistina, tetraciclina, trimetoprima/sulfametoxazol) constituyeron la mayor parte (87%) de los antimicrobianos empleados en animales según el informe de la Organización Mundial de Sanidad Animal. Conclusiones. Debido a la alta prevalencia de la resistencia a los antimicrobianos en las aves de corral en Ecuador, son imprescindibles la elaboración de directrices y regulaciones sobre el uso de antimicrobianos y el compromiso con los productores pecuarios. Es necesario fortalecer el sistema de vigilancia existente para mejorar el seguimiento del uso de antimicrobianos y de la evolución de los patrones de resistencia.


RESUMO Objetivo. Descrever perfis de resistência aos antimicrobianos em Escherichia coli e Salmonella spp. isoladas de carcaças de frango e os antimicrobianos comumente usados em animais no Equador e fornecer informações sobre padrões de resistência aos antimicrobianos para implementar medidas corretivas baseadas em evidências. Métodos. Foram coletadas amostras de carne de carcaças de frango em 199 abatedouros em todo o Equador como parte de um estudo piloto nacional para monitorar a resistência aos antimicrobianos de origem agrícola em 2019. Foram testadas amostras de E. coli e Salmonella spp. Foi avaliada a sensibilidade a 10 agentes antimicrobianos de importância crítica e três agentes antimicrobianos muito importantes (do ponto de vista da saúde humana). O relatório do país apresentado à Organização Mundial de Saúde Animal foi acessado para extrair a quantidade de antimicrobianos produzidos ou importados para uso em animais. Resultados. De 383 amostras, E. coli foi isolada em 148 (39%) e Salmonella spp. em 20 (5%). Noventa por cento dos isolados foram resistentes a pelo menos um antimicrobiano de importância crítica. A resistência foi maior à eritromicina (E. coli, 76%; Salmonella spp., 85%) e à tetraciclina (E. coli, 71%; Salmonella spp., 90%). Antimicrobianos de importância crítica ou muito importantes (colistina, tetraciclina, trimetoprim/sulfametoxazol) responderam pela maior parte (87%) dos antimicrobianos utilizados em animais, conforme o relatório da Organização Mundial de Saúde Animal. Conclusões. A alta prevalência de resistência aos antimicrobianos na avicultura no Equador exige o desenvolvimento de diretrizes e regulamentos sobre o uso de antimicrobianos e o envolvimento com os produtores de gado e avícolas. O sistema de vigilância existente precisa ser reforçado para melhorar o monitoramento do uso de antimicrobianos e a evolução dos padrões de resistência.

11.
Chinese Journal of Primary Medicine and Pharmacy ; (12): 81-86, 2023.
Article in Chinese | WPRIM | ID: wpr-991712

ABSTRACT

Objective:To investigate the clinical manifestations and related risk factors of patients with Pseudomonas aeruginosa (PAE) bloodstream infection, and to provide references for clinical diagnosis and treatment of PAE bloodstream infection after combining with bacterial resistance condition. Methods:The clinical data and biological data of all patients with PAE bloodstream infection who received treatment in the Third Affiliated Hospital of Wenzhou Medical University from January 2019 to December 2020 were analyzed retrospectively. The independent influential factors of PAE bloodstream infection were analyzed using binary logistic regression. Results:Eighty-three patients had PAE bloodstream infection. Among them, 71 patients were included in the final analysis. Among the 71 patients, 36 patients (50.70%) had carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa ( CRPA). Univariate analysis showed that the history of hospitalization within 90 days ( χ2 = 3.90, P = 0.048), indwelling catheterization ( χ2 = 5.08, P = 0.024), septic shock ( χ2 = 4.00, P = 0.046), mechanical ventilation ( χ2= 12.35, P < 0.001), deep venous catheter ( χ2 = 4.08, P = 0.043), acute physiology and chronic health evaluation score II ≥ 10 points ( χ2 = 4.06, P = 0.044), and multi-drug resistance ( χ2 = 11.75, P = 0.001) were the suspicious influential factors of CRPA bloodstream infection. Multivariate logistic regression analysis showed that mechanical ventilation was an independent risk factor for CRPA bloodstream infection ( OR = 7.43, 95% CI 1.182-46.674, P = 0.032). Multi-drug resistance was an independent risk factor for CRPA bloodstream infection ( OR = 5.842, 95% CI 1.520-22.450, P = 0.010). Conclusion:Mechanical ventilation and multi-drug resistance are the independent influential factors of CRPA bloodstream infection. Invasive operations such as mechanical ventilation should be avoided in the clinic.

12.
Biomédica (Bogotá) ; 42(4): 697-706, oct.-dic. 2022. tab, graf
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1420316

ABSTRACT

Introducción. El fluconazol es el antifúngico más utilizado para la prevención y el tratamiento de infecciones causadas por el género Cryptococcus, agente etiológico de la criptococosis. La resistencia al fluconazol en los aislamientos de Cryptoccocus neoformans puede hacer fracasar el tratamiento y generar recaídas de la infección. Objetivo. Evaluar los perfiles de expresión de los genes AFR1, MDR1 y ERG11 en aislamientos clínicos de C. neoformans var. grubii, durante la respuesta in vitro a la inducción con fluconazol. Materiales y métodos. Se estudiaron 14 aislamientos de C. neoformans var. grubii provenientes de pacientes con HIV, de los cuales 6 eran sensibles al fluconaol y 8 presentaban sensibilidad disminuida. Los niveles de expresión de los genes ERG11, AFR1 y MDR1 se determinaron mediante PCR en tiempo real. Resultados. Los aislamientos resistentes al fluconazol mostraron sobreexpresión de los genes AFR1 y MDR1, mientras que la expresión de los fenotipos de resistencia evaluados se mantuvo homogénea en ERG11, en todos los aislamientos de C. neoformans var. grubii. Conclusiones. La sobreexpresión de los genes AFR1 y MDR1 que codifican las bombas de eflujo, contribuye a la resistencia al fluconazol en los aislamientos estudiados. Sin embargo, los patrones de resistencia que se registran en este hongo, sumado a los casos de recaídas en pacientes con HIV, no pueden atribuirse únicamente a los casos de resistencia por exposición al fármaco. Otros mecanismos podrían también estar involucrados en este fenómeno, como la resistencia emergente (resistencia mediante otros genes ERG) y la heterorresistencia, los cuales deben ser estudiados en estos aislamientos.


Introduction: Fluconazole is the most used antifungal drug for prevention and treatment of Cryptococcus spp. infections, the etiological agent of cryptococcosis. Resistance to fluconazole among Cryptococcus neoformans isolates can lead to treatment failure and generate relapses. Objective: To evaluate the expression profles of the AFR1, MDR1 and ERG11 genes in C. neoformans var. grubii clinical isolates during the in vitro response to fluconazole induction. Materials and methods: Fourteen C. neoformans var. grubii isolates recovered from HIV patients were studied, in which 6 showed sensitivities to fluconazole and 8 decreased sensitivity. The expression levels of ERG11, AFR1 and MDR1 genes were determined by real-time PCR from extracted mRNA. Results: AFR1 and MDR1 genes from C. neoformans var. grubii were overexpressed in fluconazole resistant isolates, whereas ERG11 maintains homogeneous expression in all the evaluated resistance phenotypes of C. neoformans var. grubii isolates. Conclusions: The overexpression of AFR1 and MDR1 genes, which codify for efflux pumps, contributes to fluconazole resistance in the studied isolates. However, the resistance patterns in this fungus and the relapse cases in HIV patients cannot be attributed solely to the exposure to the drug. Heteroresistance and the emerging resistance (resistance through other ERG genes), might be other mechanisms involved in this phenomenon, which must be studied in these isolations.


Subject(s)
Drug Resistance, Microbial , Cryptococcus neoformans , Azoles , Fluconazole , Cryptococcosis
13.
Acta méd. costarric ; 64(3)sept. 2022.
Article in Spanish | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1447056

ABSTRACT

La resistencia a los antimicrobianos representa un peligro para la salud humana ya que pone en riesgo el valor clínico de estos medicamentos para el tratamiento y prevención de enfermedades infecciosas. Este fenómeno es multisectorial y requiere de acciones inmediatas; por ello, la Organización Mundial de la Salud ha instado a los países miembros a adoptar planes de acción al respecto. Sin embargo, es necesario implementar un marco jurídico vinculante para la regulación del uso de antimicrobianos, especialmente en los sectores de mayor consumo. El establecimiento de una legislación que asegure el uso prudente de estos medicamentos en la industria de producción animal es posible desde el bioderecho. Con este artículo se procura proponer algunas recomendaciones para la regulación de los antimicrobianos en el sector pecuario fundamentadas en el derecho internacional. Se encontró que la efectividad de estos fármacos es un bien común intrínseco en el derecho a la salud humana, cuya protección, junto con declaraciones internacionales, respalda su regulación. En el sector pecuario resulta urgente implementar medidas vinculantes para reducir su uso, especialmente de aquellos categorizados como de importancia crítica para la salud humana.


Antimicrobial resistance represents a danger to human health since it jeopardizes the clinical value of these drugs for the treatment and prevention of infectious diseases. This multisectoral phenomenon requires immediate action, which is why the World Health Organization has urged member countries to adopt action plans against antimicrobial resistance, however, it is necessary to implement a binding legal framework for the regulation of the use of antimicrobials, especially in the sectors with the highest consumption. The formulation of legislation that ensures the prudent use of these drugs in the animal production industry is possible from biolaw. In this way, this article seeks to propose regulations for the optimization of antimicrobials in the livestock sector based on international law. The effectiveness of antimicrobials was found to be an intrinsic common good in the right to human health. The protection of this right, as well as different international declarations, support the regulation of antimicrobials. In the livestock sector, it is urgent to implement binding measures to reduce the use, especially of those categorized as critically important for human health.

14.
ABCS health sci ; 47: e022203, 06 abr. 2022. tab, graf
Article in English | LILACS | ID: biblio-1363538

ABSTRACT

INTRODUCTION: Contamination of cell phones can contribute to the dissemination of pathogens in the community and/or hospital environment. OBJECTIVE: To characterize Staphylococcus aureus strains isolated from cell phones of university students. METHODS: Samples were collected from 100 cell phones. Detection of genes associated with virulence factors such as biofilm formation (icaA and icaD), enterotoxins production (SEA, SEB, SEC, and SED), and resistance to methicillin (mecA and mecC) was performed in S. aureus isolates by PCR. Typing mecA gene performed by multiplex PCR. Susceptibility to antimicrobials and biofilm formation rate also evaluated by using disk diffusion test and crystal violet staining. RESULTS: S. aureus was present in 40% of the total samples and about 70% of them belonged to Nursing students. Of the isolates, 85% presented resistance to penicillin and 50% were classified as moderate biofilm producers. In addition, 92.5% of isolates contained the gene icaA and 60% of the gene icaD. Approximately 25% of the isolates presented the mecA gene. Typing of the mecA gene showed the presence of staphylococcal chromosome cassette SCCmec I and c III respectively in 20% and 10% of the isolates. 70% of the samples could not be typed by the technique. Regarding the enterotoxins, the most prevalent gene was SEA (30%) followed by the SEC gene (2.5%). The presence of SED and SEB genes not observed in any of the isolates. CONCLUSION: The cleaning and periodic disinfection of cell phones can contribute to the reduction of the risk of nosocomial infection.


INTRODUÇÃO: A contaminação de celulares pode contribuir para a disseminação de patógenos na comunidade e/ou ambiente hospitalar. OBJETIVO: Caracterizar cepas de Staphylococcus aureus de telefones celulares de estudantes universitários. MÉTODOS: Foram coletadas amostras de 100 telefones celulares. Detecção de genes associados a fatores de virulência quanto a: formação de biofilme (icaA e icaD), produção de enterotoxinas (SEA, SEB, SEC e SED) e resistência à meticilina (mecA e mecC) foi realizada em isolados de S. aureus por PCR. A Tipagem do gene mecA foi realizada por PCR multiplex. A susceptibilidade a antimicrobianos e a taxa de formação de biofilme pelo teste de difusão em disco e coloração com cristal violeta. RESULTADOS: S. aureus esteve presente em 40% do total de amostras, destas, 70% pertenciam a estudantes do curso de enfermagem. Dos isolados, 85% apresentaram resistência à penicilina e 50% foram classificados com moderada formação de biofilme. Além disso, 92,5% dos isolados continham o gene icaA e 60% o gene icaD. Aproximadamente 25% dos isolados apresentaram o gene mecA. A tipagem do gene mecA mostrou a presença do cassete cromossômico estafilocócico SSCmec I e III em respectivamente 20% e 10% dos isolados. 70% das amostras não puderam ser identificadas pela técnica. Das enterotoxinas, o gene mais prevalente foi o SEA (30%), seguido pelo gene SEC (2.5%). A presença dos genes SED e SEB não foi observada nos isolados. CONCLUSÃO: A limpeza e desinfecção periódica dos telefones celulares podem contribuir para a redução do risco de infecção nosocomiais.


Subject(s)
Students, Health Occupations , Universities , Cell Phone , Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus , Virulence , Drug Resistance, Microbial , Biofilms , Enterotoxins
15.
Rev. gaúch. enferm ; 43: e20200485, 2022. tab
Article in English | LILACS-Express | LILACS, BDENF | ID: biblio-1389093

ABSTRACT

ABSTRACT Objective The increase in antibiotic resistance (AR) is a global phenomenon with regional variation. This survey aims to describe the AR in urine cultures of women from the community in a southern Brazil city. Methods A retrospective cross-sectional single-center study in urine cultures of community dwelling individuals. The main outcome was the AR profile of bacterial isolates from women in outpatient care. Results From 4,011 urine cultures, 524 were positive (91% from women). The most frequently isolated bacteria were Escherichia coli (E. coli) (67.0%) and Klebsiella spp. (19.4%). E. coli presented low resistance to nitrofurantoin (3.7%), moderate to levofloxacin (15.6%), amoxacillin-clavulonate (16.4%) and ciprofloxacin (17.4%), and high to trimethoprim-sulfamethoxazole (26.9%). Conclusions Nitrofurantoin seems to be the best choice for the empirical treatment of low urinary tract infections in women, whereas sulfonamides are no longer an option, since E. coli resistance to this drug is above 20%.


RESUMEN Objetivo El aumento de la resistencia a los antibióticos (AR) es un fenómeno global con variaciones regionales. Esta investigación tiene como objetivo describir la AR en cultivos de orina de mujeres de la comunidad de una ciudad del sur de Brasil. Métodos Un estudio retrospectivo transversal, de un solo centro, de cultivos de orina de la comunidad. El resultado principal fue el perfil de AR de bacterias aisladas de estos cultivos de orina. Resultados De 4.011 cultivos de orina, 524 fueron positivos (91% de las mujeres). Las bacterias más frecuentemente aisladas en mujeres fueron Escherichia coli (67,0%) y Klebsiella spp. (19,4%). E. coli mostró baja resistencia a nitrofurantoína (3,7%), moderada a levofloxacina (15,6%), amoxacilina-clavulonato (16,4%) y ciprofloxacina (17,4%) y alta a trimetoprima-sulfametoxazol (26,9%) entre las mujeres. Conclusiones La nitrofurantoína parece ser la mejor opción para el tratamiento empírico de la infección de las vías urinarias inferiores en mujeres, mientras que las sulfonamidas ya no son una opción, ya que la resistencia de E. coli a este fármaco es superior al 20%.


RESUMO Objetivo O aumento da resistência aos antibióticos (AR) é um fenômeno global com variações regionais. Esta pesquisa tem como objetivo descrever a AR em culturas de urina de mulheres oriundas da comunidade em uma cidade sul-brasileira. Métodos Um estudo de centro único, transversal e retrospectivo em culturas de urina oriundas da comunidade. O principal desfecho foi o perfil de AR de bactérias isoladas de uroculturas ambulatoriais. Resultados De 4.011 culturas de urina, 524 foram positivas (91% de mulheres). As bactérias mais frequentemente isoladas em mulheres foram Escherichia coli (67,0%) e Klebsiella spp. (19,4%). E. coli apresentou baixa resistência à nitrofurantoína (3,7%), moderada a levofloxacina (15,6%), amoxacilina-clavulonato (16,4%) e ciprofloxacina (17,4%) e alta ao trimetoprim-sulfametoxazol (26,9%) entre mulheres. Conclusões A nitrofurantoína parece ser a melhor escolha para o tratamento empírico das infecções do trato urinário inferior em mulheres, enquanto as sulfonamidas não são mais uma opção, uma vez que a resistência de E. coli a essa droga é superior a 20%.

16.
Acta Paul. Enferm. (Online) ; 35: eAPE03751, 2022. tab
Article in Portuguese | LILACS, BDENF | ID: biblio-1364223

ABSTRACT

Resumo Objetivo Caracterizar os microrganismos e sua suscetibilidade antimicrobiana em uroculturas de idosos residentes de uma instituição de longa permanência. Métodos Estudo observacional transversal com 116 indivíduos de uma Instituição de Longa Permanência para Idosos de um município do sul da Bahia. O estudo foi aprovado por Comitê de Ética em Pesquisa e utilizou-se Termo de Consentimento Livre e Esclarecido. Foram realizadas coleta e análise laboratorial de urina tipo I e urocultura. Realizaram-se testes de sensibilidade a antimicrobianos conforme os critérios do European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. Para o diagnóstico de infecção do trato urinário, foram utilizados os critérios de McGeer. A análise de dados se deu por estatística descritiva, com frequências absolutas e relativas. Resultados A prevalência de infecção do trato urinário foi de 33,62%, com predominância no sexo feminino e idade acima de 80 anos. Os uropatógenos foram: 69,2% Escherichia coli, 20,6% Klebsiella pneumoniae e 5,1% Providencia stuartii e Acinetobacter baumannii. As cepas de E. coli apresentaram suscetibilidade para a maior parte dos antimicrobianos; já nas de K. pneumoniae, a suscetibilidade foi variável. P. stuartii e A. baumannii não apresentaram resistência a carbapenêmicos e aos betalactâmicos aztreonam e piperacilina associados a tazobactam. Conclusão As cepas mais prevalentes e o perfil de suscetibilidade seguiram padrão próximo ao hospitalar, o que implica a necessidade de a instituição promover melhores estratégias de controle de infecção e envolver a equipe de enfermagem no gerenciamento dos casos e na qualificação da prescrição antimicrobiana, para reduzir a resistência bacteriana e efeitos adversos nos idosos.


Resumen Objetivo Caracterizar los microorganismos y su susceptibilidad antimicrobiana en urocultivos de adultos mayores residentes en una institución de larga estadía. Métodos Estudio observacional transversal con 116 individuos de una institución de larga estadía para adultos mayores de un municipio del sur del estado de Bahia. El estudio fue aprobado por el Comité de Ética de Investigación y se utilizó Consentimiento Informado. Se obtuvieron muestras de orina, con las cuales se realizó análisis de laboratorio tipo I y urocultivo. Se realizaron pruebas de sensibilidad a antimicrobianos según los criterios del European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. Para el diagnóstico de infección del tracto urinario, se utilizaron los criterios de McGeer. El análisis de datos se obtuvo mediante estadística descriptiva, con frecuencias absolutas y relativas. Resultados La prevalencia de infección del tracto urinario fue del 33,62 %, con predominancia del sexo femenino y edad superior a 80 años. Los uropatógenos fueron: 69,2 % Escherichia coli, 20,6 % Klebsiella pneumoniae y 5,1 % Providencia stuartii y Acinetobacter baumannii. Las cepas de E. coli presentaron susceptibilidad en la mayor parte de los antimicrobianos, en las de K. pneumoniae, la susceptibilidad fue variable. P. stuartii y A. baumannii no presentaron resistencia a carbapenémicos ni a los betalactámicos aztreonam y piperacilina asociados a tazobactam. Conclusión Las cepas más prevalentes y el perfil de susceptibilidad presentaron un patrón parecido al hospitalario, lo que implica la necesidad de que la institución promueva mejores estrategias de control de infecciones e involucre al equipo de enfermería en la gestión de los casos y en la cualificación de la prescripción antimicrobiana para reducir la resistencia bacteriana y los efectos adversos en los adultos mayores.


Resumo Objetivo Caracterizar os microrganismos e sua suscetibilidade antimicrobiana em uroculturas de idosos residentes de uma instituição de longa permanência. Métodos Estudo observacional transversal com 116 indivíduos de uma Instituição de Longa Permanência para Idosos de um município do sul da Bahia. O estudo foi aprovado por Comitê de Ética em Pesquisa e utilizou-se Termo de Consentimento Livre e Esclarecido. Foram realizadas coleta e análise laboratorial de urina tipo I e urocultura. Realizaram-se testes de sensibilidade a antimicrobianos conforme os critérios do European Committee on Antimicrobial Susceptibility Testing. Para o diagnóstico de infecção do trato urinário, foram utilizados os critérios de McGeer. A análise de dados se deu por estatística descritiva, com frequências absolutas e relativas. Resultados A prevalência de infecção do trato urinário foi de 33,62%, com predominância no sexo feminino e idade acima de 80 anos. Os uropatógenos foram: 69,2% Escherichia coli, 20,6% Klebsiella pneumoniae e 5,1% Providencia stuartii e Acinetobacter baumannii. As cepas de E. coli apresentaram suscetibilidade para a maior parte dos antimicrobianos; já nas de K. pneumoniae, a suscetibilidade foi variável. P. stuartii e A. baumannii não apresentaram resistência a carbapenêmicos e aos betalactâmicos aztreonam e piperacilina associados a tazobactam. Conclusão As cepas mais prevalentes e o perfil de suscetibilidade seguiram padrão próximo ao hospitalar, o que implica a necessidade de a instituição promover melhores estratégias de controle de infecção e envolver a equipe de enfermagem no gerenciamento dos casos e na qualificação da prescrição antimicrobiana, para reduzir a resistência bacteriana e efeitos adversos nos idosos.


Subject(s)
Humans , Male , Female , Middle Aged , Aged , Aged, 80 and over , Urinary Tract Infections/epidemiology , Drug Resistance, Microbial , Drug Resistance, Bacterial , Cross-Sectional Studies , Infection Control , Observational Studies as Topic , Homes for the Aged
17.
Rev. panam. salud pública ; 46: e186, 2022. tab, graf
Article in English | LILACS-Express | LILACS | ID: biblio-1450200

ABSTRACT

ABSTRACT Objective. To assess antibiotic use in three hospitals in three Caribbean countries based on data from 2013 and 2018 using the World Health Organization Essential Medicines List "Access, Watch, Reserve" (AWaRe) classification. Methods. A retrospective observational study, which analyzed the World Health Organization Point Prevalence Survey data from three hospitals in three Caribbean countries, to examine proportional AWaRe group antibiotic use for the top ten inpatient indications. The Access-to-Watch ratio was calculated, and the top three antibiotics prescribed in each hospital were determined. Results. The final data set included 376 prescriptions for the top ten indications in 766 inpatients. The hospital antibiotic use point prevalence for Hospital 1 was 35.6%, Hospital 2 was 48.6%, and Hospital 3 was 47.1%. The Access-to-Watch ratio for the top ten indications was 2.45, 1.36, and 1.72 in the three hospitals. Access group prevalence was 71.0% in Hospital 1, 57.6% in Hospital 2, and 63.2% in Hospital 3. There were no Reserve antibiotics prescribed in any of the institutions. The most common indication for Watch prescription was skin and soft tissue infections in Hospital 1 and pneumonia in Hospital 2 and 3. Conclusions. This study draws urgent attention to evidence of a high proportion of Watch antibiotic prescribing and lack of Reserve group antibiotics in three Caribbean countries. This research provides data that may inform national formulary and antimicrobial stewardship policy-making across the settings analyzed and the wider region.


RESUMEN Objetivo. Evaluar el consumo de antibióticos en tres hospitales de tres países del Caribe según datos del período 2013-2018 mediante la clasificación de acceso, control y reserva (AWaRe, por su sigla en inglés) de la lista de medicamentos esenciales de la Organización Mundial de la Salud. Métodos. Se realizó un estudio observacional retrospectivo, que analizó los datos de la encuesta de prevalencia puntual de la Organización Mundial de la Salud de tres hospitales en tres países del Caribe, a fin de evaluar el consumo proporcional de antibióticos por grupo de la clasificación AWaRe para las diez principales indicaciones en pacientes hospitalizados. Se calculó la relación entre los grupos de acceso y de control y se determinó cuáles eran los tres principales antibióticos prescritos en cada hospital. Resultados. El conjunto final de datos incluyó 376 recetas para las diez indicaciones principales en 766 pacientes hospitalizados. La prevalencia puntual del consumo de antibióticos en el hospital 1 fue 35,6%, en el hospital 2 fue 48,6% y en el hospital 3 fue 47,1%. La relación entre los grupos de acceso y de control correspondientes a las diez principales indicaciones fue 2,45, 1,36 y 1,72 en los tres hospitales. La prevalencia del grupo de acceso fue 71,0% en el hospital 1, 57,6% en el hospital 2 y 63,2% en el hospital 3. No se prescribieron antibióticos del grupo de reserva en ninguna de las instituciones. La indicación más común para la prescripción de antibióticos en el grupo de control fue infecciones en la piel y los tejidos blandos en el hospital 1 y neumonía en los hospitales 2 y 3. Conclusiones. Este estudio busca llamar la atención urgentemente sobre la evidencia de una alta proporción de prescripción de antibióticos del grupo de control y la carencia de antibióticos del grupo de reserva en tres países del Caribe. Esta investigación proporciona datos que pueden fundamentar el formulario nacional y la elaboración de políticas para la optimización del uso de antimicrobianos en los entornos analizados y en la región en general.


RESUMO Objetivo. Avaliar o uso de antibióticos em três hospitais de três países do Caribe, com base em dados de 2013 e 2018, usando a classificação "Acesso, Vigilância e Reserva" (AWaRe) da Lista de Medicamentos Essenciais da Organização Mundial da Saúde. Métodos. Estudo observacional retrospectivo com análise de dados do Estudo de Prevalência Pontual da Organização Mundial da Saúde, coletados em três hospitais de três países do Caribe para examinar o uso proporcional de antibióticos dos grupos AWaRe para as dez indicações mais frequentes em pacientes internados. A razão entre os grupos Acesso e Vigilância foi calculada e determinou-se quais eram os três antibióticos mais prescritos em cada hospital. Resultados. O conjunto final de dados incluiu 376 medicamentos prescritos para as dez indicações mais frequentes em 766 pacientes internados. A prevalência pontual de uso de antibióticos foi de 35,6% no hospital 1, 48,6% no hospital 2 e 47,1% no hospital 3. A razão entre Acesso e Vigilância nas dez indicações mais frequentes foi 2,45, 1,36, e 1,72 nos três hospitais. A prevalência do grupo Acesso foi de 71,0% no hospital 1, 57,6% no hospital 2 e 63,2% no hospital 3. Nenhum antibiótico da categoria Reserva foi prescrito em nenhuma das instituições. A indicação mais comum dos medicamentos prescritos no grupo Vigilância foram infecções de pele e tecidos moles no hospital 1 e pneumonia nos hospitais 2 e 3. Conclusões. Este estudo chama urgentemente a atenção para evidências de uma grande proporção de antibióticos prescritos no grupo Vigilância e a carência de antibióticos do grupo Reserva em três países do Caribe. Esta pesquisa fornece dados que podem guiar a criação de políticas para o formulário terapêutico nacional e o uso racional de antimicrobianos nos cenários analisados e na região como um todo.

18.
Chinese Journal of Perinatal Medicine ; (12): 904-911, 2022.
Article in Chinese | WPRIM | ID: wpr-995035

ABSTRACT

Objective:To investigate the microbiota distribution and drug resistance in gravidas with suspected infection to provide a reference for the treatment of maternal infectious diseases.Methods:This retrospective study analyzed the distribution and in vitro antimicrobial susceptibility of microorganisms isolated from obstetric patients in Beijing Obstetrics and Gynecology Hospital Affiliated to Capital Medical University (Beijing Maternal and Child Health Care Hospital) from January 1, 2016. to December 31, 2019. Matrix-assisted laser desorption ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF-MS) was used to identify pathogenic microorganisms. The susceptibility of isolated pathogenic bacteria to common antimicrobial agents was detected using bioMerieux VITEK-2 (France). Descriptive statistical methods was used. Results:A total of 4 086 strains were isolated from 3 781 samples of 3 225 gravidas and 44.17% (1 670) of the strains were from secretion specimens, including 767 cervical, 423 vulvovaginal, 318 perineum wound and 117 uterine secretion specimens. The most common bacterium was Escherichia coli (1 728, 42.29%), followed by Saccharomyces (901, 22.05%), Streptococcus (429, 10.50%), Enterococcus (377, 9.23%), and Staphylococcus (300, 7.34%). The proportion of Enterococcus among all the positive bacteria increased during the study period with its ranking rising from the 5th in 2016 to the 3rd in 2019, while the ranking of the proportion of Staphylococcus fell from the 4th in 2016 to the 5th in 2019. More than 90% of Escherichia coli were sensitive to carbapenems, piperacillin/tazobactam, amikacin, nitrofurantoin and ceftazidime, but only 35% or less to ampicillin and cefazolin. More than 98% of Candida strains were sensitive to amphotericin, but less than 56% to itraconazole. From 2016 to 2019, the sensitivity of Escherichia coli to cefuroxime sodium and ceftriaxone remained around 65%. The sensitive rate of Candida albicans to voriconazole and fluconazole gradually decreased from about 90% to 56%. The most common Enterococcus was Enterococcus faecalis and its susceptibility to vancomycin, ampicillin, penicillin, linezolid, nitrofurantoin and levofloxacin were all over 90%. Conclusions:Escherichia coli is the most common pathogenic microorganism in gravidas with suspected clinical infection and its susceptibility to cefuroxime sodium and ceftriaxone is stable. Candida albicans shows a gradually decreased susceptibility to voriconazole and fluconazole, which needs close attention. The proportion of Enterococcus in all pathogenic bacteria increases significantly over time, while that of Staphylococcus decreases.

19.
Chinese Journal of Laboratory Medicine ; (12): 943-949, 2022.
Article in Chinese | WPRIM | ID: wpr-958604

ABSTRACT

Objectives:To investigate the genetic characteristics of the blaNDM-1-carrying plasmid of the multidrug resistant Enterobacter hormaechei subsp. hoffmannii clinical isolate C37, and constructing a phylogenetic tree of the 66 publicly available genomes of the Enterobacter hormaechei subsp. hoffmannii to explore its global epidemic situation. Methods:Carbapenem-resistant Enterobacter cloacae complex (CRECC) strains isolated from the First Affiliated Hospital of Sun Yat-sen University from August 2014 to August 2021 were collected. Matrix-assisted laser desorption/ionization-time of flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) and 16S rDNA Sanger sequencing were used for species identification. Micro broth dilution method was used for antibacterial susceptibility test. The polymerase chain reaction (PCR) was used to detect the β-lactamase resistance gene and plasmid-mediated quinolone resistance (PMQR) gene carried by the C37 strain. The conjugation experiment was used to confirm the conjugative metastasis of the resistance genes in C37 strain. Whole genome of the C37 strain was sequenced. Core genome was extracted and the phylogenetic analysis of 66 publicly available Enterobacter hormaechei subsp. hoffmannii was performed. Results:Enterobacter hormaechei subsp. hoffmannii C37 strain is resistant to third-generation cephalosporins, carbapenems, aminoglycosides and quinolones, and carries blaACT-5, blaNDM-1, qnrA1, aac(6′)-Ib-cr, oqxAB, fosA, dfrA15 and other resistance genes, as well as IncX3, IncX4, IncFIB and IncFII plasmids. Multilocus sequence typing (MLST) analysis showed that C37 strain belongs to the ST78 type of Enterobacter cloacae complex (ECC). Conclusions:ST78 type Enterobacter hormaechei subsp. hoffmannii is closely related to the spread of carbapenem resistance genes. It is a potential high-risk clone to spread carbapenem resistance genes. The prevalence and trends of ST78 type Enterobacter hormaechei subsp. Hoffmannii should be monitored.

20.
Biomédica (Bogotá) ; 41(supl.2): 180-187, oct. 2021. tab, graf
Article in Spanish | LILACS | ID: biblio-1355769

ABSTRACT

Resumen | Introducción. La aparición de enterobacterias multirresistentes y productoras de betalactamasas de espectro extendido (BLEE) en pacientes de consulta externa con infecciones urinarias, representa un problema de salud pública en Perú. Objetivos. Caracterizar molecularmente enterobacterias multirresistentes aisladas de pacientes con diagnóstico de infección urinaria y procedentes de dos departamentos de la selva peruana. Materiales y métodos. Se hizo un estudio descriptivo, observacional y retrospectivo de 61 aislamientos de urocultivo procedentes de la selva peruana durante 2017 y 2018. Los perfiles de resistencia se identificaron utilizando el sistema automatizado MicroScan™ y para la detección de los genes blaTEM, blaCTX-M, blaSHV se empleó una reacción en cadena de la polimerasa (PCR) convencional. Resultados. Las enterobacterias positivas para BLEE más frecuentes por departamento fueron Escherichia coli en Madre de Dios (25 %, 10/40) y Ucayali (76,2 %, 16/21). En ambos departamentos, el gen blaCTX-Mfue el más frecuente (25/61; 41 %), seguido por blaTEM(15/61; 24,6 %) y blaSHV (10/61; 16,4 %). En el perfil de sensibilidad antimicrobiana, se detectó 72,6 % de resistencia contra ampicilina, 82,3 % contra cefalotina y 88,7 % contra nitrofurantoína. Conclusiones. El porcentaje de cepas de enterobacterias multirresistentes productoras de BLEE en ambos departamentos fue del 57,4 % y el gen bla CTX-M fue el más frecuente.


Abstract | Introduction. The emergence of multiresistant enterobacteria producing extended-spectrum beta-lactamase (ESBL) in outpatients with urinary tract infections represents a public health problem in Perú. Objectives. To characterize multiresistant enterobacteria isolated from patients diagnosed with urinary tract infection in two Peruvian jungle departments using molecular techniques. Materials and methods. We conducted a descriptive, observational, and retrospective study of 61 urine culture isolates from two departments in the Peruvian jungle during 2017-2018. Resistance profiles were identified using the MicroScan™ automated system and a conventional polymerase chain reaction (PCR) was used for the detection of blaCTX-M, blaTEMand blaSHV genes. Results. The most common positive ESBL enterobacteria for each department were Escherichia coli in Madre de Dios (10/40; 25%) and Ucayali (16/21; 76.2%). Gene blaCTX-Mwas the most prevalent in both departments (25/61; 41%), followed by blaTEM (15/61; 24.6%), and blaSHV (10/61; 16.4%). As for the antimicrobial susceptibility profile, we detected resistance levels of 72.6% for ampicillin, 82.3% for cephalothin, and 88.7% for nitrofurantoin. Conclusions. BLEE-producing multi-resistant enterobacteria strains in both departments were 57.4% and blaCTX-M was the most common gene.


Subject(s)
Drug Resistance, Microbial , Enterobacteriaceae , beta-Lactam Resistance , Genes
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